PyMOL - Download

良いもの

PyMOL が真価を発揮するのはカラーリング システムです。 1 つのコマンドで、特定の残基 (たとえば、触媒部位のすべてのヒスチジン) を強調表示できます。 「チェーンごと」カラー オプションを使用して複合体内のサブユニットを分離すると、突然構造が単なるブロブではなくなりました。カチッとしました。そして測定ツールは？超精密。公開されている値と照らし合わせて結合の長さと角度を再確認したところ、完全に一致しました。また、Python を使用したスクリプト作成はゲームチェンジャーです。さまざまな角度からタンパク質の側面図を自動的に生成する簡単なスクリプトを作成し、時間を節約しました。エクスポート オプションは PNG、PDF、さらにはアニメーションもサポートしているため、これらを手間なくスライドやレポートにドロップできます。

あまり良くないこと

さて、本当のことを言いましょう。インターフェースは最初は…恐ろしいものです。それを開けると、白衣を着ずに誰かの研究室に入ったような気分になります。手繋ぎは無し。しかし、正直に言って、15 分ほど調べてみると、意味が分かり始めます。それでも、初心者はチュートリアルに従わないと道に迷ってしまう可能性があります。実際に役立つ組み込みのヘルプ メニューはありません。「漫画」表現が何であるかをすでに知っていることを前提としたドキュメントへのリンクがあるだけです。無料ではありますが、学習に時間がかかるため、カジュアルな使用には適していません。分子を一度確認して次に進みたい場合は、ArgusLab (これも無料) の方が使いやすいかもしれません。さらに、タッチスクリーンやローエンド マシン用に最適化されていません。私の古いラップトップは、重いレンダリング中に途切れてしまいました。

結論

教育、研究、または分子生物学の研究に携わっている場合、PyMOL - Windows 用ダウンロードは絶対に入手する価値があります。無料で、ほとんどのアプリで有料のツールが満載されており、出力の品質は最高レベルです。それを理解するのに少し時間がかかることを期待してください。タンパク質や低分子を扱う本格的な作業を行う人にとって、これは最高の無料ツールの 1 つです。ただ閲覧している場合、または非常にシンプルなものが必要な場合にのみスキップしてください。さもないと？さあ、ダウンロードしてください。後で自分に感謝するでしょう。